Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gapvd1Q6PAR5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gapvd1Q6PAR5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms