Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atl2Q6PA06 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atl2Q6PA06 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms