Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms