Protein–RNA interactions for Protein: Q6P566

Lix1, Protein limb expression 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lix1Q6P566 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lix1Q6P566 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms