Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnpo3Q6P2B1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnpo3Q6P2B1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms