Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Szrd1Q6NXN1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Szrd1Q6NXN1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms