Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mvb12bQ6KAU4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mvb12bQ6KAU4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms