Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt77Q6IFZ6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt77Q6IFZ6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms