Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KdsrQ6GV12 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KdsrQ6GV12 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms