Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Edrf1Q6GQV7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Edrf1Q6GQV7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms