Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp11bQ6DFW5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms