Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tmcc1Q69ZZ6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tmcc1Q69ZZ6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmcc1Q69ZZ6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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