Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzrn3Q69ZS0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Pdzrn3Q69ZS0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Pdzrn3Q69ZS0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Pdzrn3Q69ZS0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Pdzrn3Q69ZS0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdzrn3Q69ZS0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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