Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ric1Q69ZJ7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ric1Q69ZJ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms