Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cntn4Q69Z26 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms