Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc3Q64519 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdc3Q64519 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sdc3Q64519 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms