Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Abcg1Q64343 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcg1Q64343 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcg1Q64343 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcg1Q64343 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcg1Q64343 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcg1Q64343 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms