Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Surf4Q64310 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Surf4Q64310 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Surf4Q64310 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Surf4Q64310 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms