Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sf1Q64213 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms