Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ss18Q62280 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ss18Q62280 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms