Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SypQ62277 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SypQ62277 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SypQ62277 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SypQ62277 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SypQ62277 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SypQ62277 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SypQ62277 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms