Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sall3Q62255 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sall3Q62255 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms