Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ssr4Q62186 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ssr4Q62186 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms