Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sema3cQ62181 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sema3cQ62181 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms