Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhocQ62159 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RhocQ62159 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RhocQ62159 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RhocQ62159 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms