Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sin3bQ62141 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sin3bQ62141 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms