Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prm3Q62100 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Prm3Q62100 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Prm3Q62100 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Prm3Q62100 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Prm3Q62100 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Prm3Q62100 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Prm3Q62100 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prm3Q62100 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms