Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rai1Q61818 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rai1Q61818 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rai1Q61818 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rai1Q61818 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rai1Q61818 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rai1Q61818 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rai1Q61818 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai1Q61818 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rai1Q61818 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms