Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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AtrxQ61687 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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AtrxQ61687 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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AtrxQ61687 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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AtrxQ61687 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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AtrxQ61687 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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AtrxQ61687 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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AtrxQ61687 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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AtrxQ61687 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AtrxQ61687 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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AtrxQ61687 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtrxQ61687 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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