Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Msi1Q61474 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Msi1Q61474 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms