Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtcfQ61164 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtcfQ61164 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms