Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Klf3Q60980 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Klf3Q60980 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms