Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxd4Q60688 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxd4Q60688 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms