Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HnrnpdQ60668 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HnrnpdQ60668 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms