Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ClpbQ60649 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClpbQ60649 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms