Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prdm1Q60636 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms