Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Specc1Q5SXY1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms