Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms