Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam71bQ5STT6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam71bQ5STT6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms