Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdh12Q5RJH3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh12Q5RJH3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms