Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav8d-2Q5R1B6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms