Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms