Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scarf1Q5ND28 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms