Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spata48Q5NC83 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spata48Q5NC83 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms