Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttf2Q5NC05 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms