Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp22Q5DU02 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp22Q5DU02 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms