Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2f8Q58FA4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f8Q58FA4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f8Q58FA4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f8Q58FA4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f8Q58FA4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f8Q58FA4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2f8Q58FA4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms