Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CenpjQ569L8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpjQ569L8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms