Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrig2Q52KR2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms