Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ankrd28Q505D1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ankrd28Q505D1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms